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污染物去除的实质是以臭气作为营养物质被微生物吸收、代谢及利用。这一过程是微生物的相互协调的过程，比较复杂，它由物理、化学、物理化学以及生物化学反应所组成。

当含有气、液、固三项混合的有毒、有害、有恶臭的废气经收集管道导入本系统后通过培长在生物填料上的微生物菌株形成的生物膜来净化和降解废气中的污染物。
此生物膜一方面以废气中的污染物为养料，进行生长繁殖；另一方面将废气中的有毒、有害恶臭物质分解，降解成无毒无害的 CO2，H2O，H2SO4，HNO3等简单无机物，从而达到除臭的目的。

生物除臭原理：大水、微生物和氧存在的条件下，利用微生物的代谢作用氧化分解发臭物质，以达到净化气体的目的。生物处理大致可以分为3个过程。
1、恶臭气体被填料载体(固有微生物)吸附;
2、恶臭气体向微生物表面扩散、被微生物吸附;
3、微生物将恶臭气体生物降解。不含氮的恶臭物质被分解成CO和H₂O，含硫恶臭物质被分解成S,SO₃²⁻，SO₄²⁻，含氮恶臭物质则被分解成NH₄⁺,NO₂⁻,NO₃⁻。

恶臭去除的三个阶段：
1、废气中有毒、有害、恶臭污染物与水接触，溶于水中且能够成为液相中的分子或离子。这一过程是物理过程，遵循亨利定律：Pi+=HXi。
2、中溶液中的恶臭成分被微生物吸附、吸收，恶臭成分从水中转移至微生物体内。
3、进入微生物中的有机物在各种内酶的催化作用下，微生物对其进行氧化分解，同时进行合成代谢产生新的微生物。一部分有机物通过氧化分解终转化为H2O，CO2等稳定的无机物。
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